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简介高迁移率族蛋白B1
发布时间:2017-05-02   点击次数:649次

简介高迁移率族蛋白B1基本信息

高迁移率族蛋白于1973年在牛胸腺中被提取和鉴定,因其在聚丙烯酰胺凝胶电泳中的高迁移能力而得名。具体可参见Ferrari S, Finelli P, Rocchi M, Bianchi ME (July 1996). "The active gene that encodes human high mobility group 1 protein (HMG1) contains introns and maps to chromosome 13". Genomics 35 (2): 367–71. doi:10.1006/ge996.0369. PMID8661151.。根据分子质量大小、序列相似性和DNA结构特性,HMG可进一步分为HMGA、HMGB、HMGN 3个家族。而HMGB家族又有3个成员,即HMGB1、HMGB2和HMGB3,三者在氨基酸序列上有80%的一致性。HMGB1是含量zui丰富的HMG蛋白,在典型的哺乳动物细胞内约有106个分子,平均10~15个核小体即可含有1个HMGB1分子。HMGB1广泛分布于淋巴组织、脑、肝、肺、心、脾、肾等组织中,HMGB1除在肝、脑组织中主要存在于胞浆外,在大多数组织中存在于胞核;而HMGB2/3分布较局限,HMGB2仅分布在淋巴组织中,HMGB3仅在胚胎中被发现,二者可能与胚胎发育有关。HMGB1先前也称HMG1,在进化过程中其氨基酸序列高度保守,啮齿类动物与人的氨基酸序列同源性高达98%以上,小鼠与大鼠氨基酸序列同源性更是高达。

简介高迁移率族蛋白B1结构

(1)人类HMGB1基因位于13q12染色体上。HMGB1基因包括5个外显子和4个内含子[5]。HMGB1基因有十分强大的TATA盒启动子。它的zui大活性是猴病毒40(SV 40)启动子的18倍。这个启动子还包括数个转录因子结合位点,如激活蛋白1(AP1)。此外还包含一个沉默元件(silencer element),因此,在一般环境条件下,HMGB1的表达量维持在基础水平[6]。HMGB1基因敲除后幼鼠仍能存活,但存在广泛的形态畸形,多于出生24 h内死亡。

(2)人类HMGB1的初级氨基酸序列中含有219个氨基酸残基,成熟HMGB1分子质量为30 ku。HMGB1蛋白由3个独特的结构域组成。其中A-box位于N-末端,进化高度保守;C-tail在羧基末端,包含30个重复的天冬氨酸和谷氨酸残基,可参与调节HMGB1与DNA结合的亲和力;B-box位于二者之间。A-box和B-box均由3个α螺旋组成,并带有强烈的正电荷,构成HMGB1的非特异性DNA结合区。HMGB1释放至胞外后,B-box是引起炎症反应的功能结构域,而A-box对B-box有一定的拮抗作用[7]。此外,人们把一个与A-box和B-box结构域同源,约含85个氨基酸的重复区命名为DNA结合基元,为区别起见,将DNA结合基元的蛋白称为HMG-box。HMG-box起源古老,其中包括序列特异性DNA结合蛋白和非特异性结合蛋白,系辨认和结合变形DNA所必需的结构[8]。HMGB1在不同的物种中高度保守,大鼠与小鼠的HMGB1蛋白序列完全一致,与人类HMGB1蛋白的不同点只是C末端重复序列中有2个残基被置换。

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